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Mikrobieller Abbau von Chloraromaten : Gene des ortho- und meta-Weges / eingereicht von Markus Göbel. 2003
Inhalt
Einleitung
Der Abbau von Aromaten und Chloraromaten über de
Der Abbau von Aromaten und Chloraromaten über de
Ziele und Aufgabenstellungen der Arbeit
Material und Methoden
Bakterienstämme und Plasmide
Bakterienstämme und Plasmide für die Untersuchun
Bakterienstämme und Plasmide für die Untersuchun
Oligonukleotide
Oligonukleotide bei den Untersuchungen des modifizierten ortho-Weges
Oligonukleotide bei den Untersuchungen des meta-Weges
Stammhaltung
Chemikalien, Medienbestandteile und Enzyme
Chemikalien
Medienbestandteile
Enzyme
Kits
Verschiedenes
Sequenzanalyse und Computerprogramme
Geräte
Nährmedien zur Kultivierung von E. coli und Pseu
LB-Medium
SOB-Medium
SOC-Medium
Minimalmedium
King-Agar B
Isolierung von Chlorbenzol-Verwertern
Isolierung ohne Selektion
Anreicherung mit verlangsamter Chlorbenzoldiffusion
Isolierung von DNA
Isolierung plasmidischer DNA aus E. coli
Isolierung von Gesamt-DNA
Enzymatische Hydrolyse von DNA
Gelelektrophorese
Isolierung von DNA aus Agarose-Gelen
Quantifizierung von DNA
Klonierung von DNA
Ligation von DNA mit Plasmid-DNA
Herstellung von transformationskompetenten E. coli-Zellen
Transformation von E. coli DH5?
Verwendung von Klonierungskits und Aufarbeitung der eingesetzten DNA
Polymerasekettenreaktion (PCR)
Enzymaktivitäten
Enzymaktivitäten des unteren ortho-Weges
3-Oxoadipat:Succinyl-CoA-Transferase-Aktivität
3-Oxoadipyl-CoA-Thiolase-Aktivität
3-Oxoadipat-Enollacton-Hydrolase-Aktivität
Enzymaktivitäten des meta-Weges
Chlorcatechol-2,3-Dioxygenase-Aktivität
2-Hydroxypent-2,4-dienoat-Hydratase-Aktivität
Acetaldehyd-Dehydrogenase \(acylierend\)-Aktiv
4-Oxalocrotonat-Isomerase-Aktivität
Nukleinsäure-Blotting
DNA-Blotting (Southern-Blot)
Dot-Blot
Kolonie-Blot
Radioaktive Markierung von DNA
Hybridisierung
Hybridisierungs-Reaktion
Autoradiographie
Experimente und Ergebnisse
Gene des unteren ortho-Weges in Pseudomonas sp. B13
Die 3-Oxoadipyl-CoA-Thiolase
Die 3-Oxoadipat:Succinyl-CoA-Transferase
Die 3-Oxoadipat-Enollacton-Hydrolase
Sequenzanalyse der Region stromabwärts von catD
Der meta-Weg
Anzucht und Isolierung neuer Stämme mit Chlorcat
Identifizierung der neuen Chlorbenzol-abbauenden
Identifizierung der Stämme SK1, 16-6A und MG61
RAPD-Analysen
RAPD-Analyse der Stämme GJ31, SK1 und 16-6A
RAPD-Analyse der Stämme MG61 und 16-6A
Klonierung und Sequenzierung der Chlorcatechol-2,
Expression der Chlorcatechol-2,3-Dioxygenasen und
Design cbzE-spezifischer Primer
Klonierung der Nukleotidsequenzen stromauf- und s
Die Hydratase, Aldolase und Dehydrogenase des unt
Diskussion
Gene des unteren ortho-Weges in Pseudomonas sp. B13
Chlorbenzol-verwertende Neuisolate und ihre Gene des meta-Weges
Isolierung von Stämmen mit Chlorcatechol-2,3-Dio
Vergleich der Chlorcatechol-2,3-Dioxygenasen
Evolutionäre Aspekte
Die cbzJ-, cbzQ- und cbzK-Gene der Stämme SK1 un
Ausblick
Literatur
Anhang